Bergen Vitensenter AS har følgende eiere: 
Bergen kommune – 29,56 % 
Hordaland fylkeskommune – 19 % 
Universitetet i Bergen – 19 % 
Høgskulen på Vestlandet – 19 % 
Bergen Næringsråd – 0,76 % 
Bergen Børsfond – 8,45 %
Jacobs Douwe Egberts Norge AS – 4,22 %

Styret:
Bergen Vitensenter AS sitt styre består av representanter for eierne, samt Equinor og interesseorganisasjoner.
Styreleder: Roald Onarheim (Bergen kommune)
Nestleder: Atle Kvamme (Bergen Næringsråd)

Styremedlemmer:
Synnøve Solbakken
Helga Flesche Kleiven
Sven Erik Thulin
Kjellrun Hiis Hauge
Silje Skjelsvik
Benedicte A. Wolff (ansattes representant)

Varamedlemmer:
John Andre Kongsvik
Oded Ben-Horin
Nils Petter Hauan (ansattes representant)